包皮過長的害處歸結起來主要有以下幾點：

一、影響陰莖發育：包莖和包皮過長會影響陰莖的生長發育，使性器官發育成熟后的陰莖頭冠部的周徑明顯小，此外還能影響正常的性生活，性快感降低。

二、容易使陰莖發炎：包皮內有豐富的皮脂腺分泌大量的皮脂。包莖或包皮過長時，皮脂和尿中的沉淀物不能排出形成乳酪狀奇臭的“包皮垢”甚至形成“包皮結石”。包皮垢適宜細菌生長，故可引起龜頭及包皮發炎。

三、容易上行感染甚至損害內臟：由于陰莖發炎，可以導致尿道發炎，尿道發炎以后可能癥狀會比較輕微，不會引起人的注意，通過喝水、排尿，癥狀消失了，病人不會察覺到有問題。殊不知，致病菌還會慢慢逆行往上感染，引發前列腺炎、精囊炎、附睪炎、甚至膀胱炎、腎炎等。

四、有致癌的危險：現代科學研究表明，長時間包皮垢的刺激可以大大增加患陰莖癌的風險。